Factores de virulência em Streptococcus pyogenes

Tese de mestrado. Biologia (Biologia Celular e Biotecnologia). Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2010Streptococcus pyogenes, um dos agentes patogénicos mais comuns a nível mundial, pode provocar uma grande variedade de patologias como faringites, amigdalites, infecções da pele e tecidos moles ou patologias mais graves como a escarlatina e a síndrome do choque tóxico. Na tentativa de ajudar a esclarecer se a presença de factores de virulência está relacionada com a origem dos isolados, no presente trabalho foi realizada a pesquisa de genes de virulência (e.g. speA, speC, speH, speJ, speI, speK, speL, speM, prtF1, spd1, slaA, ssa) em 208 isolados de S. pyogenes provenientes de quatro origens distintas: colonização, faringite/laringite, infecção da pele/tecidos moles e doença invasiva. De modo a complementar o estudo foi analisada a expressão génica de quatro dos genes de virulência (speA, ssa, slaA e spd1) em vinte isolados seleccionados da amostra inicial, após crescimento em dois meios de cultura, BHI e 2YT. Adicionalmente, e de forma a averiguar se esses mesmos genes seriam de origem fágica, procedeu-se ainda a testes em placa após indução com mitomicina C. Como principais resultados pode-se referir que enquanto para os isolados de colonização a percentagem de presença de genes de virulência apresenta um máximo de 38,7% (36/93), nos isolados provenientes de infecção atinge o valor de 83,3% (10/12). Estes resultados levam a crer que, isolados provenientes de doença invasiva apresentam maior quantidade de genes de virulência. Dos quatro genes pesquisados no estudo preliminar de expressão génica apenas para dois, spd1 e ssa, foi observada expressão nas condições em análise, sendo o maior nível de expressão observado no meio de cultura BHI, que simula condições de infecção. Globalmente, os resultados obtidos no presente estudo indicam uma associação entre factores de virulência e doença invasiva, tanto no estudo de presença como no de expressão. No entanto, devido ao número reduzido de isolados incluídos nos estudos de expressão e indução, as conclusões retiradas necessitam de confirmação em futuras investigações.Streptococcus pyogenes, is one of the most common pathogens worldwide. It can cause several diseases such as pharyngitis, tonsillitis, skin and soft tissues infections or other more severe pathologies, like scarlet fever and streptococcal toxic shock syndrome. In order to know if the presence of streptococcal virulence factors is associated with the origin of the isolates, we performed a screening for the presence of virulence genes (e.g. speA, speC, speH, speJ, speI, speK, speL, speM, prtF1, spd1, slaA, ssa) in 208 isolates of S. pyogenes from four distinct origins: colonization, tonsillitis/pharingytis, skin and soft tissues infections and invasive disease. In order to complement the previous analysis, we selected four virulence genes (speA, ssa, slaA e spd1) and studied their gene expression in twenty isolates selected from the initial sample, after growth in two media, BHI and 2YT. Additionally, in order to verify if the same genes had fagic origin, we performed plate assays after induction with mitomycin C. The results showed that isolates from colonization possess 38,7% (36/93) of virulence genes, while infection isolates presented up to 83,3% (10/12). These results suggest an association between isolates from invasive disease and a higher number of virulence genes. Regarding gene expression, two of the four genes were analyzed, spd1 e ssa, were expressed during growth in BHI and 2YT. The higher level of expression was observed when using BHI, a medium simulating infection settings. As for the induction with mitomycin C, we were able to verify that four of the isolates induced halos, pointing to the presence of bacteriophages in those streptococci. Overall, the results obtained in the present investigation pointed towards an association between virulence factors and invasive disease, regarding both their presence and expression. However, due to the small number of isolates included in the expression and induction studies these conclusions need further confirmation in future investigations

Brief Thoughts on Power and Cyberspace

Num Estado de Direito, a luta política entre os vários grupos, que defendem ou atacam interesses de classe, económicos, profissionais, geracionais, de género, ou outros, embora regulada, é uma constante. Governos, empresas e cidadãos, individulamente ou em grupo, lutam pelos seus objectivos estabelecendo relações de poder. Os media sempre tiveram um papel instrumental neste contexto e o novo media do séc. XXI – o ciberespaço – não é excepção. As características estruturais e funcionais deste instrumento criaram novas condições para a mobilização e participação políticas, reavivando a crença na acção libertadora da técnica. Por outro lado, nenhuma outra tecnologia promoveu tanta concentração de poder nas grandes empresas da indústria digital, ou criou semelhantes condições para a vigilância activa dos cidadãos por parte dos Estados. Este artigo reune algumas reflexões sobre a importância do ciberespaço como dimensão de poder.Abstract: The political struggle among groups defending or attacking class, economic, professional, generational, gender or any other interests, although regulated, is a constant. Governments, businesses and citizens, individually or as a group, fight for their porpuses by establishing relations of power between them, the media had always played an instrumental role with this regard and the new media of the 21st century – the cyberspace – is no exception. The structural and functional features of this new media fosters the conditions for the mobilisation and political action, bringing to life the strong belief on the liberating role of the technique. On the other hand, no other technology has promoted so much concentration of power in large companies, namely the digital industry, or created similar conditions for State surveillance of their citizens. This article gives us some reflections on the meaning of cyberspace as a dimension of power

Efficacy of COVID-19 vaccines in patients with chronic liver diseases

Tese de Mestrado, Biologia Molecular e Genética, 2023, Universidade de Lisboa, Faculdade de CiênciasA pandemia COVID-19 forçou o desenvolvimento de vacinas capazes de conferir imunidade face ao SARS-CoV-2. Porém, nos vários ensaios clínicos, bem como nos estudos efetuados após a admissão e administração da vacina á população geral, vários grupos de risco não foram tidos em conta, como é o caso dos doentes hepáticos crónicos. Estes doentes apresentam, tipicamente, respostas imunitárias deficientes às vacinas. E embora a eficácia clínica em doentes hepáticos immunocomprometidos seja desconhecida, a vacinação é fortemente recomendada. O desenvolvimento de anticorpos em resposta à infeção é só uma parte da reposta imunitária de um organismo. Existe a necessidade de estudar não só estes anticorpos, mas também a resposta das células do sistema imunitário - imunidade celular. No seu conjunto, com este trabalho pretende-se estudar a eficácia das vacinas contra o SARS-CoV-2 em doentes hepáticos crónicos. Os objetivos delineados para este projeto são: avaliar a imunidade humoral de doentes hepáticos crónicos para compreender a extensão temporal desta proteção imune e de tal forma averiguar a sua eficácia. Adicionalmente entender se há a necessidade de reforço imunitário para além dos protocolos de vacinação estipulados para a população geral. Para a recolha de dados desta população, uma coorte de doentes hepáticos foi selecionada do Hospital de Santa Maria que apresentam variedade na idade, género, raça altura, peso, comorbidades, estágio de doença e medicação metabólica. Esta tese visa caraterizar esta coorte de doentes hepáticos de um ponto de vista imunitário recorrendo á testagem de dois isótipos de anticorpo (IgG e IgM) juntamente com a testagem de anticorpos neutralizantes e assim determinar a eficácia das vacinas na proteção contra o vírus. Foi feito um acompanhamento regular em fases temporais específicas denominadas de “timepoints” nomeadamente T0 (baseline), T2 (2 semanas após a 2ª dose) e T3 (6 meses após o início da vacinação) onde foi feita uma recolha de sangue por um profissional de saúde e consequentemente o processamento da amostra de sangue em laboratório. No processamento das amostras foi utilizado um protocolo de isolamento usando centrifugação para obter o soro com anticorpos extraído passando a seguir para a análise dos anticorpos. Adicionalmente foram extraídas também células mononucleares do sangue periférico para a análise em futuros estudos. Foram realizados testes aos dois isótipos de anticorpo através de um protocolo de ELISA para determinar a concentração de anticorpos nas amostras recolhidas face á estirpe selvagem e as variantes mais comuns (Delta e Omicron). Adicionalmente foram considerados resultados provenientes de testes de neutralização das mesmas amostras. Inicialmente foi organizada uma tabela que representava a coorte sendo composta por 43 homens e 20 mulheres dentro dos quais 28 dos pacientes eram cirróticos (44%). A grande maioria foi vacinada com Pfizer (49%) seguida pela Astrazeneca (14%) e finalmente Johnson & Johnson (11%). Observou-se um pico imunidade em T2 que quando comparado aos resultados de pré-vacinação demonstravam um crescimento significativo nas concentrações de IgG e IgM como também na percentagem de anticorpos neutralizantes, tendo o IgG resultados mais elevados que os outros devido a quantidade em circulação. Seguidamente foi feita uma análise com base nas caraterísiticas clínicas da coorte com base no principal anticorpo, IgG, em que foi observado um decrescer com o avanço da idade e/ou com a progressão de condições hepáticas como a fibrose, esteatose hepática e a cirrose. Condições como o consumo alcoólico excessivo também levaram a níveis inferiores de anticorpos circulantes sendo correlativo de uma imunidade mais baixas. Alguns dos resultados foram inesperados como o grupo de fumadores, pacientes com doenças autoimunes ou até sob medicação imunossupressora que podem ser explicados pela pequena amostra de indivíduos que representam estes grupos não havendo valor estatístico significante associado. Relativamente à eficácia das diferentes vacinas, estas permanecem em ordem crescente de eficácia esperada (J&J, Astrazeneca Pfizer) sendo a Moderna excluída pelo facto de só haver um individuo com dados sobre esta vacina. Foi feita uma distinção entre os pacientes mediante os valores do anticorpo IgG em T2 no qual foi observado uma diferença estatisticamente relevante. Foi feita uma distinção entre os indivíduos da população baseada na concentração de anticorpos face a vacinação em T2 criando dois grupos: "low responders" e "high responders". Foi observado uma diferença estatisticamente relevante entre os dois grupos. Finalmente procedeu-se á comparação do efeito da vacinação entre a estirpe selvagem e as variantes Delta e Omicron onde se determinou que há uma relação inversamente proporcional face á imunidade que as vacinas conferem mediante o número de mutações das diferentes variantes. Visto que a variante Omicron é a mais afastada em termos evolucionários da estirpe selvagem os resultados comprovaram que a concentração de anticorpos face a esta variante era substancialmente menor (p value = 0.0016). Conclui-se que a vacinação embora eficiente inicialmente, após os 6 meses observa-se um declínio da imunidade ao longo do tempo e tendo em conta a geração de novas variantes que sucessivamente tornam-se mais resistentes e evasivas aos mecanismos do sistema imune, o protocolo atual de duas doses não é suficiente .Isto leva á necessidade de um protocolo com uma maior frequência de doses de vacinação e com a possibilidade do método de vacinação heterogénea, que consiste essencialmente de vacinar indivíduos com base em um protocolo que utilize mais do que uma plataforma de vacinação. Tem-se vindo a provar mais eficiente que a utilização de uma só plataforma de vacinação. Futuramente é também vital compreender o papel da imunidade celular e das células T maturadas que intervém na defesa do organismo pois interagem diretamente com as células infetadas. Células mononucleares do sangue periférico extraídas neste estudo serão um bom exemplo para futuros estudos de forma a compreender melhor a interação destas células e que importância têm na defesa do organismo. Como tal a investigação deste sistema de imunidade poderá beneficiar na produção de novos tipos de vacina que impulsionem uma defesa mais rigorosa e duradoura que a proporcionada pelas vacinas atuais.The COVID-19 pandemic has caused serious public health concerns since 2020. Several studies have shown that patients with chronic liver disease (CLD) present with inherent immune dysfunction which appear to associate with worse COVID-19 infection consequences, leading to higher risk of mortality. Vaccines that were approved for the general public lack insights on specific population groups, including patients with CLD, calling for the need of additional investigations of vaccine efficacy in these subgroups. This study aimed to assess the humoral immunity of CLD patients vaccinated against COVID-19 and the extension of protection that the vaccines may confer. To achieve this, a cohort of CLD patients were recruited from Centro Hospitalar Universitário Lisboa Norte, Portugal, regardless of etiology and disease stage. Blood sampling and processing allowed for the extraction of serum used in the analysis of IgGs ,IgMs and neutralizing antibodies (NAbs) by ELISA and neutralization assays, respectively. Results showed that antibody levels and NAbs percentage were significantly increased in patients with CLD following the vaccination protocol. Clinical characteristics such as older age, alcoholism and cirrhosis had a negative impact on the immune response of patients. Immune responses measured at 6-months following vaccination were significantly decreased, comparing with the previous time point. Altogether, our results indicate that patients with CLD, particularly those with cirrhosis and advanced age present with lower immune responses to COVID-19 vaccination. As such, this specific population should be prioritized for receiving booster doses no longer than 6 months after vaccination

Taxes and women in the labour force in a Southern European country: the case of Portugal

Abstract. On looking at the female labour supply in Europe, it is immediately noticed that there is a large variation among countries. One possible explanation for this fact is that different countries have different tax policies, leading to variations in incentive and costs. This has been investigated in papers such as that of Gustafsson (1992a,b) for countries such as Germany and Sweden. The same exercise has been performed by the present authors for a low-income, southern European country, Portugal, which has one of the highest rates of female participation (out of line with neighbouring countries). Female labour supply does not seem to be very sensitive to fiscal policies, as those policies have only a small influence on the take-home wage. This result appears to be independent of the fact that the female labour supply shows a higher elasticity to wages than that which has been reported for other countries. The present authors also show that Portuguese women contribute a much larger proportion of family earnings than do their counterparts in Sweden and Germany, and that the Portuguese fiscal system is rather neutral. Further studies with data from other countries are needed in order to shed more light on the issue of tax harmonization.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Estilos Educativos Parentais (EMBU-A), Sintomatologia Depressiva/Ansiosa, Stress e Autoestima, numa Amostra de Adolescentes

Introdução. Os estilos educativos parentais enquanto clima educativo geral apresentam um forte impacto em diferentes resultados desenvolvimentais (e.g., sintomatologia depressiva/ansiosa e auto estima) da criança/jovem. Podem ser estudados de um ponto de vista dimensional, considerando, por exemplo, as dimensões Controlo/Sobreproteção e Suporte, ou categorial, seguindo, por exemplo, a abordagem de Baumrind, e Maccoby e Martin. Neste estudo pretendemos: verificar se existem diferenças por género e idade, nas dimensões Suporte Emocional, Sobreproteção e Rejeição (EMBU-A) (cada progenitor separadamente), na sintomatologia depressiva/ansiosa e na auto estima; avaliar se existem diferenças nas dimensões do EMBU-A, entre progenitores, na amostra total e por género; explorar associações entre as variáveis centrais do estudo (estilos educativos, sintomatologias e auto estima) e variáveis sociodemográficas, também nas três amostras; explorar diferenças entre quatro grupos criados (Pai-Filho, Pai-Filha; Mãe-Filho e Mãe-Filha) nas dimensões do EMBU-A; combinando a Sobreproteção e o Suporte Emocional (EMBU-A), e definindo os estilos educativos parentais autoritário, autoritativo, permissivo e negligente, calcular a prevalência dos mesmos na nossa amostra (por Pai e por Mãe) e explorar as suas associações com as sintomatologias e com a auto estima (separadamente, por progenitor). Metodologia. A nossa amostra é constituída por 284 adolescentes (idade média = 14,5; DP = 1,68; raparigas, n = 171, 60,2%). Todos preencheram um protocolo composto por um questionário sociodemográfico, pela Rosenberg Self- Esteem Scale (RSES), pelo DASS-21 e pelo Parental Rearing Style Questionnaire for use with Adolescents (EMBU-A/A). Resultados. De salientar o facto de os adolescentes percecionarem a mãe como apresentando valores mais elevados em todas as dimensões do EMBU-A, por comparação com o pai. Da mesma forma, ainda que com diferentes padrões de associação conforme o género, é de salientar a associação entre níveis maiores de Suporte emocional e níveis mais baixos de sintomatologia depressiva/ansiosa e stress, e a associação entre as dimensões Sobreproteção e Rejeição e níveis superiores desses resultados. Uma mais baixa escolaridade do pai associa-se a menor Suporte emocional e uma maior escolaridade da mãe a maior Sobreproteção. Uma díade constituída por progenitor e adolescente do género masculino apresenta resultados inferiores em todas as dimensões do EMBU-A, por comparação com díades formadas por mãe-filho/filha. O estilo Autoritativo é o mais prevalente na nossa amostra (em ambos os progenitores) e o estilo Autoritário é aquele que se associa a pontuações mais elevadas de psicopatologia e a uma menor auto estima. Discussão. De uma forma, genérica os resultados seguem de perto a literatura e revelam a associação entre valores mais elevados na dimensão Suporte emocional e níveis mais baixos de psicopatologia e stress, e a associação entre as dimensões Sobreproteção e Rejeição e níveis superiores desses resultados. Igualmente, o estilo educativo Autoritário está claramente associado a piores resultados nessas mesmas variáveis. São discutidas algumas implicações, no que toca a programas psicoeducativos/educação parental. / Introduction. As a general educational environment, parental rearing styles have a strong impact in different outcomes of development of the child or teenager (e.g. symptoms of depression/ anxiety and self-esteem). These can be studied from a dimensional point of view considering for example the dimensions Control/Overprotection and Support or from a categorical point of view following for example the approach of Baumrind and Maccoby and Martin. This study aims at checking whether there are differences of gender and age in the dimensions of Emotional Support, Overprotection and Rejection (EMBU-A) (each parent separately) in depressive symptoms/anxiety and self esteem; assessing whether there are differences in the dimensions of the EMBU-A, between parents in the total sample and by gender; exploring associations between the study’s main variables (rearing styles, symptomatology and self esteem) and sociodemographic variables, also in the three samples; exploring differences between the four groups created (Father-Son, Father-Daughter, Mother-Son and Mother-Daughter) in the dimensions of the EMBU-A, combining Overprotection and Emotional Support(EMBU-A) and defining the authoritarian, authoritative, indulgent, and neglectful parental rearing styles. The aim is also to estimate the prevalence of these in our sample (by Father and Mother) and explore their associations to the symptomatology and self esteem (separately, per parent). Methodology. Our sample is composed of 284 teenagers (average age = 14,5; DP = 1,68; girls, n = 171, 60,2%). All participants filled in a protocol of questionnaires consisting of a set of socio demographic questions by Rosenberg Self- Esteem Scale (RSES), by DASS-21 and by Parental Rearing Style Questionnaire for use with Adolescents (EMBU-A/A). Outcomes. It is important to emphasize the fact that teenagers perceive their mother as having higher values in all the EMBU-A dimensions compared to their father. In the same way, though with different patterns of association according to gender, it is important to emphasize the association of higher levels of Emotional Support and lower levels of depressive/anxious symptomathology and stress and the association of Overprotection and Rejection and higher levels of those outcomes. A father’s lower level of education is associated to a lower Emotional Support while a mother’s higher level of education is associated to a greater Overprotection. A dyad composed of male parent and male teenager presents lower outcomes in all EMBU-A dimensions if compared to dyads composed of mother-son/daughter. The authoritative style is the most prevalent in our sample (in both parents) and the authoritarian style is the one associated to higher scores of psychopathology and lower levels of self esteem. Debate. In general, the outcomes closely follow the literature review and reveal the association of higher values in the Emotional Support dimension and lower levels of psychopathology and stress and also the association of the dimensions of Overprotection and Rejection and higher levels of those outcomes. Equally, the authoritarian rearing style is clearly associated to the worst outcomes in those same variables. Some implications are discussed as far as psychoeducational programmes and parental rearing are concerned

Phytochemicals properties and antioxidant activities of some accessions of Phaseolus vulgaris L

Common bean is a legume important in Mediterranean diet with interesting nutritional food characteristics due to its proteins, fibers and antioxidant activity. There is an increased interest among consumers in foods rich in natural antioxidants for maintaining and improving health. Beyond this, beans are a low-price food and an excellent complement for the population with low income. There are some differences in the phenolic and flavonoid compounds content and antioxidant capacity between accessions of common bean. In this study, 15 traditional Portuguese and 1 Greek accessions of Phaseolus vulgaris L. were analyzed. Total phenols, ortho-diphenols and flavonoid contents were investigated and antioxidant activity were measured by different assays (DPPH, ABTS) which may give a better characterization of this activity

A importância da literacia orçamental para a prossecução da transparência orçamental - o caso de Portugal

Comunicação em ConferênciaRegras orçamentais aplicáveis a Portugal, a partir da saída do PDE em junho de 2017. Manutenção do saldo orçamental acima de 3 do PIB. Garantia de convergência do saldo estrutural em direção ao OMP ( fixado em 0 25 do PIB). No período transitório 2017 19 Portugal deverá fazer progressos suficientes com vista à redução do rácio da dívida.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Swarm Robotic Plume Tracking for Intermittent and Time-Variant Odor Dispersion

This paper presents a method for odor plume tracking by a swarm of robots in realistic conditions. In real world environments, the chemical concentration within an odor plume is patchy, intermittent and time-variant. This study shows that swarm robots can cooperatively track the odor plume towards its source by establishing a cohesive spatial sensor network to deal with the turbulences and patchy nature of odor plumes. The robots move together and maintain a distance margin between themselves in order to keep the cohesion of the constructed sensor network while the odor concentration and air-flow speed are considered in the equations of navigation of the robots in the network to more efficiently track the plume. The method is evaluated in simulation against various number of robots, the emission rate of the odor source, the number of obstacles in the environment and the size of the testing environment. The emergent behavior of the swarm proves the functionality, robustness and scalability of the system in different conditions

Trawling and creeling for nephrops: impacts on biodiversity and populations structure

Dissertação de mestrado, Aquacultura e Pescas, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade do Algarve, 2015The Norway Lobster (Nephrops norvegicus) is a deep- water burrowing decapod crustacean with a widespread distribution ranging from Iceland, the Faroe Island and northwestern Norway to the south Atlantic coast of Morocco with a patchy distribution on the Mediterranean Sea. In the Portuguese shelf and slope areas, adults are found on depths ranging from 90 to 800 m depth. The distribution of this species seems to be limited to high percentage of mud bottoms. Along the years this species acquired some importance in the fisheries sector due to its market value. It is nowadays one of the main species in crustaceans’ bottom trawling in Europe. The fishing activity for the exploitation of this species has shown some environmental impacts. In particular, trawl fisheries are known to directly impact the bottoms, and are associated with considerable amounts of bycatch and discards. Recently, the European community has turned the attention to creel fishery for Nephrops, encouraging the change from trawl to creel in this fishery in order to reduce the bycatch. During this study it was possible to observe that there is a clear difference between both gears in what respects the commercial value of Nephrops caught as well as in terms of species affected by the gears.O lagostim (Nephrops norvegicus) é um crustáceo bentónico de águas profundas, com uma distribuição ampla que se estende desde a Islândia, as Ilhas Faroé e o noroeste da Noruega até a costa atlântica sul de Marrocos e ainda uma distribuição em bolsas dispersas no Mar Mediterrâneo. Os indivíduos adultos de Nephrops norvegicus podem ser encontrados nas zonas de plataforma continental e no talude entre os 90m e os 800m de profundidade em águas portuguesas. A distribuição nesta espécie pode ir desde fundos de vasa compacta ate fundos de vasa arenosa. Ao longo dos anos esta espécie adquiriu alguma importância no sector das pescas devido ao seu crescente valor no mercado e é hoje em dia uma das principais espécies no arrasto de fundo de crustáceos na Europa. A atividade pesqueira resultante da exploração desta espécie tem demonstrado impactos ambientais negativos, com especial foco nos efeitos das redes de arrasto. Recentemente a pesca de Lagostim tem sido alvo de atenção por parte da Comunidade Europeia, com incentivos para a mudança de arte de captura da rede de arrasto para armadilhas, numa tentativa de redução das capturas acessórias. Durante este estudo foi possível verificar que existem diferenças bastante demarcadas entre os dois tipos de artes utilizadas. Estas diferenças verificam-se nomeadamente a nível do valor comercial do lagostim e nas espécies afetadas por cada uma das artes

As finanças públicas e a cidadania e a educação fiscal

Comunicação em ConferênciaA cidadania e a educação fiscal - A cidadania fiscal e as finanças públicas. Medidas para estimular a cidadania fiscal – luta contra a economia paralela e a evasão e fraude fiscais. Medidas para estimular a cidadania fiscal – aumento da transparência orçamental.info:eu-repo/semantics/publishedVersio